Trwają prace nad implementacją od strony programowej i sprzętowej serwera do przetwarzania i analizy surowych danych z genomów prokariotycznych z Oxford Nanopore NGS. Po przeprowadzeniu eksperymentu pierwszego sekwencjonowania oraz dopracowaniu protokołu sekwencjonowania zespół projektowy przystąpił do praktycznej realizacji koncepcji serwera, którego robocza nazwa brzmi NanoForms. W ten sposób powstanie nowatorskie bioinformatyczne narzędzie, które będzie bezpłatne dla naukowców. Osoby nie posiadające umiejętności w zakresie (bio)informatyki będą mogły w prosty sposób uzyskać dostęp do wstępnego przetwarzania ich surowych danych sekwencyjnych w celu uzyskania na wyjściu zapisów sekwencji o odpowiedniej jakości. Nasz serwer jest w stanie obsłużyć małe genomy (do 50 MB). Użytkownik serwera załaduje zarchiwizowany, pojedynczy plik sekwencji (fastq), następnie dane będą wstępnie przetwarzane a użytkownik na bieżąco wybierze kilka dostępnych opcji i po kolejnych krokach uzyska sekwencję DNA/RNA w postaci pliku fasta. Szczegóły dotyczące opracowywanego rozwiązania zostaną opublikowane w artykule naukowym zgłoszonym do czasopisma indeksowanego w bazach WoS/Scopus.
X
