Strona: Hodowla nowego szczepu bakterii Bacillus subtlis MSP4 / Zakład Systemów Złożonych

Hodowla nowego szczepu bakterii Bacillus subtlis MSP4

2020-08-20
, red.  Michał Wroński

Uzyskano nowe mutanty termotolerancyjnego szczepu Bacillus subtlis MSP4 otrzymane na drodze mutagenezy chemicznej z wykorzystaniem bromku etydyny. Przeprowadzona mutageneza zwiększyła maksymalną temperaturę wzrostu względem szczepu macierzystego z 50 do 60°C. Kolejnym krokiem będzie zsekwencjonowanie DNA genomowego otrzymanych mutantów, a następnie przeprowadzenie analizy bioinformatycznej w celu identyfikacji konkretnych mutacji w ich genomowym DNA. Używana technologia sekwencjonowania Oxford Nanopore na urządzeniu MinION wraz z odczynnikami Field Sequencing Kit SQK-LRK001 oraz Flow Cell R9.4.1 FLO-MIN106D. Stosowany aktualnie w projekcie protokół pozwala na optymalizację procesu sekwencjonowania zaś wyżej wymienione odczynniki zwiększają ilość dobrych jakościowo danych dostarczonych do tworzonego w ramach projektu serwera, zapewniając w ten sposób jego prawidłową konfigurację i pracę, jak również prawdopodobieństwo zidentyfikowania kolejnych mutacji genowych analizowanych szczepów Bacillus sp. mających wpływ na poprawę określonych aktywności enzymatycznych. Stosowane w projekcie rozwiązanie  pozwala na utrzymanie bardzo dobrej jakości otrzymanych bibliotek genomowego DNA wynikające z dedykowanych odczynników Oxford Nanopore wchodzących w skład zestawów MinION Starter Pack.

Powrót do listy aktualności

Nasze serwisy używają informacji zapisanych w plikach cookies. Korzystając z serwisu wyrażasz zgodę na używanie plików cookies zgodnie z aktualnymi ustawieniami przeglądarki, które możesz zmienić w dowolnej chwili. Więcej informacji odnośnie plików cookies.

Akceptuję